L'organigramma del museo d'Orsay riunisce attorno alla Presidenza cinque servizi: amministrazione generale, servizio della conservazione, servizio culturale, servizio dell'auditorium e servizio della comunicazione.



La Presidenza dell'Istituto pubblico del museo d'Orsay riunisce sotto l'autorità diretta del presidente il settore delle pubblicazioni, il settore del mecenatismo e quello delle relazioni internazionali.
Posto sotto la diretta autorità del presidente dell'istituto, il servizio della conservazione è organizzato in sei discipline specifiche: pittura, scultura e medaglistica, arte decorative, architettura, fotografie e disegno.
I conservatori che formano tale servizio sono membri permanenti del consiglio scientifico dell'istituto e ad essi possono essere assegnati anche incarichi trasversali.
Oltre ai settori – mostre, acquisizioni, direzione e amministrazione delle opere, laboratori museografici, laboratorio fotografico, la conservazione si occupa altresì di un settore di ricerca che gestisce una documentazione ed una biblioteca.
La missione del servizio culturale è quella di ideare e programmare l'offerta culturale del museo a vantaggio di ogni tipologia di pubblico. Tale servizio riguarda i seguenti settori: pubblicazioni, produzioni audiovisive, internet e prodotti multimediali, conferenze e convegni, il settore educativo e la documentazione.
Tale servizio progetta e mette in opera la programmazione nell'ambito musicale, cinematografico, teatrale e nel settore della danza d'intesa con i servizi dell'istituto.
Sottoposto al diretto controllo del presidente dell'edificio, questo servizio garantisce, mediante l'elaborazione di una strategia di comunicazione, la promozione del museo, delle sue collezioni e di tutte le sue attività, sia in Francia che negli altri Paesi. Un'altra finalità che tale servizio si prefigge è la ricerca di partenership finanziarie per mezzo dello sviluppo di forme di mecenatismo. Il servizio di comunicazione comprende i seguenti settori: relazioni pubbliche e istituzionali, relazioni di stampa, relazioni esterne e forme di mecenatismo internazionale, laboratorio grafico e tipografia.
L'amministrazione generale è composta, in particolare, dai seguenti dipartimenti: relazioni pubbliche e vendita, accoglienza e sorveglianza, gestione e sicurezza, informatica, museografia e edilizia, amministrazione e finanze, risorse umane. Tale servizio organizza ed assicura la gestione dell'istituto in rapporto con tutti gli altri servizi.